云南省农业科学院是云南省人民政府直属的综合型、公益性农业科研机构。其历史沿革可以追溯到1912年，民国政府在昆明创办省农事试验场；1950年新中国成立后省政府在昆明市大普吉组建了云南省农业试验站；1958年设于重庆的西南农业科学研究所与云南省农业试验站合并，成立云南省农业科学研究所；1976年，撤销云南省农业科学研究所，成立云南省农业科学院。主要职能职责是：承担云南省全局性、关键性、战略性重大农业科技问题研究，推动科技创新和成果转化，为云南高原特色现代农业发展提供农业科技支撑引领；同时，按国家发展战略、部署安排，研究区域农业发展科技问题，开展国际农业科技交流合作，为云南省及周边农业经济发展提供服务支持。
长期以来，省农科院主动服务全省农业农村发展大局，紧紧围绕“三农”重大科技需求，全力抓好科技创新和成果转化工作，为全省粮食安全和重要农产品有效供给、传统产业提升改造、新兴产业培育、重要农业生物资源开发利用、农业面源污染治理及生态安全提供了有力的科技支撑，为全省高原特色现代农业发展、决战脱贫攻坚、决胜全面建成小康社会、全面推进乡村振兴作出了重要贡献。
省农科院机关设有11个处室，院下设粮食作物、农业环境资源、园艺作物、经济作物、生物技术与种质资源、农业经济与信息、花卉、质量标准与检测技术、药用植物、农产品加工、国际农业、甘蔗、茶叶、热带亚热带经济作物、高山经济植物、热区生态农业、蚕桑蜜蜂等17个研究所，其中在昆研究所11个，其余6个研究所分布在红河、西双版纳、保山、丽江、楚雄等州市，主要研究学科、领域和方向目前有8个重大学科群（主要粮食作物、主要经济作物、种质资源与遗传育种创新、作物栽培与耕作制度、农业资源与生态环境、农产品质量安全与食品营养、农产品加工与农业工程、农业信息与农业农村经济）、18个重要学科领域（重要粮食作物、特色粮食作物、重要经济作物、特色经济作物、农业生物资源、遗传育种、农业生物技术、栽培与生理、植物保护、土壤肥料及环境友好型经营、农业资源保护利用、农业生态环境治理及乡村环境美化、农产品质量与食品安全、农产品加工、农业工程、数字农业、农业农村经济、政策与管理）和48个重点研究方向。
截至2022年底，现有在职职工1684人，其中专业技术人员1402人；具有高级职称698人，博士152人、硕士649人。农业农村部创新团队3个、省顶尖团队2个、省创新团队20个。设立院士专家工作站24个，院内123名专家在全省设立专家基层工作站171个。全院35名专家担任国家现代农业产业技术体系首席科学家、岗位科学家和综合试验站站长；68名专家担任省农业产业技术体系首席科学家、岗位专家和试验站站长，其中首席科学家9名。共有各类平台67个，其中，种质资源库（圃）21个、重点实验室8个、科创研究中心类平台20个、检测鉴定类平台6个、科学观测站12个,搭建起了支持开展科研工作和面向社会特别是广大农村农民的农业科技信息服务网络，建立了一大批不同层级的实验平台。
立足百年基业，再创百年辉煌。站在新的起点，省农科院将坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入学习贯彻党的二十大精神和省第十一次党代会精神，落实好云南省“3815”战略，聚焦建设特色农业强省，锚定“现代化强院”的发展目标，突出“讲团结、抓落实、争先进”的3点工作要求，推进科技创新、成果转化、人才队伍、条件平台、党的建设等5项重点工程，实施百团千员助农增收、现代种业创新提升、强链延链核心技术攻关、农业科技走出去、农科平台共建共享、创新团队效能提升、党建引领创新发展等7个三年行动，以“1357”工作布局推动我院一年一进步、三年上台阶，为我省粮食安全和重要农产品有效供给、建设特色农业强省、巩固拓展脱贫攻坚成果同乡村振兴有效衔接做出重要贡献。
（相关数据截至2023年3月）
